Le système d'élection de la Bistoquette est basé sur le système de scrutin "par mention majoritaire". Il s'agit qui permet notamment de réduire l'effet des "petites candidatures" sur les résultats finaux ainsi que l'utilité du "vote stratégique". De cette manière, il permet de mieux représenter les préférences des électeurs que le système uninominal à un ou deux tours.
Concrètement, les électeurs assignent une mention à chaque candidat selon une étiquette, par exemple: "très favorable", "favorable", "neutre", "plutôt contre" ou "absolument contre", ou à l'aide d'étiquettes de couleur (de vert à rouge par exemple). Par la suite chaque candidat reçoit une mention correspondant à la valeur médiane des avis qu'il a reçus (valeur minimale ayant été choisie par au moins la moitié des des électeurs). La valeur médiane étant moins sensible que la valeur moyenne aux votes extrêmes, cela réduit l'utilité du vote stratégique. Enfin, tous les candidats sont classés selon la mention qu'ils ont reçues. En cas d'égalité, on prend en considération la proportion de votes pour les mentions plus extrêmes.
Ce système peut également être utilisé pour départager des propositions, et non seulement des candidats.